MEM: Differentiate functional cache accesses from CPU and memory

This patch changes the functionalAccess member function in the cache
model such that it is aware of what port the access came from, i.e. if
it came from the CPU side or from the memory side. By adding this
information, it is possible to respect the 'forwardSnoops' flag for
snooping requests coming from the memory side and not forward
them. This fixes an outstanding issue with the IO bus getting accesses
that have no valid destination port and also cleans up future changes
to the bus model.

stats: undo parser change from initparam change

Alpha: warn_once about broken PAL breakpoints.

A recent changeset (aae12ce9f34c) removed support for
PAL-mode breakpoints in Alpha, since it was awkward
and likely unused.  This patch lets a user know if they
potentially run into this limitation.

debug: fix AllFlags::disable()

Looks like copy-and-paste bug, apparently I'm the first
person to ever use this since it's plainly broken.

inorder: MDU deadlock fix

mips: compatibility between MIPS_SE and cross compiler from CodeSorcery

mips: Fix bugs in faults.cc/hh and tlb.cc for MIPS_FS

mips: Fix decoder of two float-convert instructions

mips: definition of MIPS64_QNAN in registers.hh

PerfectCacheMemory: Remove references to CacheMsg
The definition for the class CacheMsg was removed long back. Some declaration
had still survived, which was recently removed. Since the PerfectCacheMemory
class relied on this particular declaration, its absence let to compilation
breaking down. Hence this patch.

Packet: Put back part of the assert

Packet: Remove meaningless assert statement

Ruby: Use map option for selecting b/w sparse and memory vector

Config: Add support for restoring using a timing CPU
Currently there is an assumption that restoration from a checkpoint will
happen by first restoring to an atomic CPU and then switching to a timing
CPU. This patch adds support for directly restoring to a timing CPU. It
adds a new option '--restore-with-cpu' which is used to specify the type
of CPU to which the checkpoint should be restored to. It defaults to
'atomic' which was the case before.

Ruby: Resurrect Cache Warmup Capability
This patch resurrects ruby's cache warmup capability. It essentially
makes use of all the infrastructure that was added to the controllers,
memories and the cache recorder.

Ruby Debug Flags: Remove one, add another
The flag RubyStoreBuffer is being removed, instead RubySystem is being added

Ruby Port: Add a list of cpu ports attached to this port

Ruby EventQueue: Remove unused functions

Ruby Sparse Memory: Add function for collating blocks
This patch adds function to the Sparse Memory so that the blocks can be
recorded in a cache trace. The blocks are added to the cache recorder
which can later write them into a file.

Ruby: Add infrastructure for recording cache contents
This patch changes CacheRecorder, CacheMemory, CacheControllers
so that the contents of a cache can be recorded for checkpointing
purposes.

Ruby Memory Vector: Functions for collating and populating pages
This patch adds functions to the memory vector class that can be used for
collating memory pages to raw trace and for populating pages from a raw
trace.

Ruby: remove the files related to the tracer
The Ruby Tracer is out of date with the changes that are being carried
out to support checkpointing. Hence, it needs to be removed.

hgfilesize: skip files that have been removed

MOESI Hammer: Update regression test output

MOESI Hammer: Remove a couple of bugs
A couple of bugs were observed while building checkpointing support in Ruby.
This patch changes transitions to remove those errors.

Sparse Memory: Simplify the structure for an entry
The SparseMemEntry structure includes just one void* pointer. It seems
unnecessary that we have a structure for this. The patch removes the
structure and makes use of a typedef on void* instead.

Automated merge with ssh://repo.gem5.org/gem5

config: Fix json output for Python lt 2.6.

DPRINTF: Improve some dprintf messages.

X86 Regressions: Update stats due to fence instruction

X86: Add memory fence to I/O instructions

Config: Remove short option string for cpu type

CPU: Remove Alpha-specific PC alignment check.

Config: Fix issue with JSON output

Packet: Add derived class FunctionalPacket to enable partial functional reads

This adds the derived class FunctionalPacket to fix a long standing
deficiency in the Packet class where it was unable to handle finding data to
partially satisfy a functional access.  Made this a derived class as
functional accesses are used only in certain contexts and to not add any
additional overhead to the existing Packet class.

stats: fix Vector2d to display stats correctly when y_subname is not specified.

Vector2d stats with no y_subname were not displayed as the VectorPrint subname was not initialized correctly to reflect the empty field.

sim: Enable sampling of run-time for code-sections marked using pseudo insts.

This patch adds a mechanism to collect run time samples for specific portions
of a benchmark, using work_begin and work_end pseudo instructions.It also enhances
the histogram stat to report geometric mean.

O3: Remove some asserts that no longer seem to be valid.

config: support outputing a pickle of the configuration tree

mem: Change DPRINTF prints more useful destination port number.
Old code prints 0 for destination since pkt->getDest() returns 0 for
pkt->getDest() == Packet::Broadcast, which is always true.

O3: Add support of function tracing with O3 CPU.

ARM: Add support for running multiple systems

stats: Update stats for ARM init param changes.

ARM: Add support for initparam m5 op

Base: Fixed shift amount in genrand() to work with large numbers

The previous version didn't work correctly with max integer values (2^31-1 for
32-bit, 2^63-1 for 64bit version), causing "shift" to become -1.  For smaller
numbers, it wouldn't have caused functional errors, but would have resulted in
more than necessary loops in the while loop.  Special-cased cases when (max + 1
== 0) to prevent the ceilLog2 functions from failing.

cpu2000: Add missing art benchmark to all

SWIG: Make gem5 compile and link with swig 2.0.4

To make gem5 compile and run with swig 2.0.4 a few minor fixes are
necessary, the fail label issues by swig must not be treated as an
error by gcc (tested with gcc 4.2.1), and the vector wrappers must
have SWIGPY_SLICE_ARG defined which happens in pycontainer.swg,
included through std_container.i. By adding the aforementioned include
to the vector wrappers everything seems to work.

MAC: Make gem5 compile and run on MacOSX 10.7.2

Adaptations to make gem5 compile and run on OSX 10.7.2, with a stock
gcc 4.2.1 and the remaining dependencies from macports, i.e. python
2.7,.2 swig 2.0.4, mercurial 2.0. The changes include an adaptation of
the SConstruct to handle non-library linker flags, and Darwin-specific
code to find the memory usage of gem5. A number of Ruby files relied
on ambigious uint (without the 32 suffix) which caused compilation
errors.

Merged with Nate's commit

Ruby Cache: Add param for marking caches as instruction only

hooks: Add a hook to limit the size of any individual file

AbstractController: Remove some of the unused functions

--HG--
extra : rebase_source : 78df7398a609f1db8a2592cd2d1bdc9156d1b8c3

Ruby Set: Move NUMBER_WORDS_PER_SET to Set.hh
This constant is currently in System.hh, but is only used in Set.hh. It
is being moved to Set.hh to remove this artificial dependence of Set.hh
on System.hh.

--HG--
extra : rebase_source : 683c43a5eeaec4f5f523b3ea32953a07f65cfee7

Config: Add an option of type 'choice' for cpu type
This patch adds a new option for cpu type. This option is of type 'choice'
which is similar to a C++ enum, except that it takes string values as
possible choices. Following options are being removed -- detailed, timing,
inorder.

--HG--
extra : rebase_source : 58885e2e8a88b6af8e6ff884a5922059dbb1a6cb

eventq: add a function for replacing head of the queue
This patch adds a function for replacing the event at the head of the queue
with another event. This helps in running a different set of events. Events
already scheduled can processed by replacing the original head event back.
This function has been specifically added to support cache warmup and
cooldown required for creating and restoring checkpoints.

--HG--
extra : rebase_source : ed6e2905720b6bfdefd020fab76235ccf33d28d1

MESI Coherence Protocol: Fix L2 miss statistics
This patch removes calls to uu_ProfileMiss from transitions where the request
is satisfied by the L2 cache controller.

--HG--
extra : rebase_source : e59fe7c6cd5795c0019cf178dd3b062d73cc2ff5

X86 TLB: Move a DPRINTF to its correct place
The DPRINTF for doing protection checks appears after the checks have been
carried out. It is possible that the function returns while the checks are
being carried, in which case the printf is missed out. This patch moves the
DPRINTF before the checks.

--HG--
extra : rebase_source : 172896057e593022444d882ea93323a5d9f77a89

Ruby: Shuffle some of the included files
This patch adds and removes included files from some of the files so as to
organize remove some false dependencies and include some files directly
instead of transitively.

--HG--
extra : rebase_source : 09b482ee9ae00b3a204ace0c63550bc3ca220134

SLICC: Use pointers for directory entries
SLICC uses pointers for cache and TBE entries but not for directory entries.
This patch changes the protocols, SLICC and Ruby memory system so that even
directory entries are referenced using pointers.

--HG--
extra : rebase_source : abeb4ac78033d003153751f216fd1948251fcfad

ARM: Update config files for Android/BBench images available on website.

--HG--
extra : rebase_source : ca98021c3f96422374fbd4500da312a5a9dd00df

IO: Fix bug in DMA Device where receiving a snoop on DMA port would cause a panic.

--HG--
extra : rebase_source : 8152d4fa7d7354c9f150a450ae0710e95141ba4b

gcc: fix unused variable warnings from GCC 4.6.1

--HG--
extra : rebase_source : f9e22de341493a25ac6106c16ac35c61c128a080

Trace: FIx issue with creation of trace file with output dir overhaul.

--HG--
extra : rebase_source : c1ab57ea8805703d97cdee4f32410821a2d2a9db

regress: updated hammer memtest and rubytest outputs

--HG--
extra : rebase_source : b02ad38b477d87bf28f7677c985ec7fe9a7d4694

config: command line option to specify ruby output file

--HG--
extra : rebase_source : df2237b2ce01b1a3e1d6f112a62deadde4d92420

MOESI_hammer: fixed L2 to L1 infinite stalls and deadlock

--HG--
extra : rebase_source : 90f217f28e195a8cee5d64b25c913b452d818676

physmem: Improved fatal message for size mismatch

--HG--
extra : rebase_source : 16da1c63263f8fd6fef9a842c577343cd6246a35

VNC: Add support for capturing frame buffer to file each time it is changed.

When a change in the frame buffer from the VNC server is detected, the new
frame is stored out to the m5out/frames_*/ directory.  Specifiy the flag
"--frame-capture" when running configs/example/fs.py to enable this behavior.

--HG--
extra : rebase_source : d4e08e83f4fa6ff79f3dc9c433fc1f0487e057fc

Output: Add hierarchical output support and cleanup existing codebase.

--HG--
extra : rebase_source : 3301137733cdf5fdb471d56ef7990e7a3a865442

SE: Don't warn when not extending stack as it's too noisy with O3.

--HG--
extra : rebase_source : e56d1551d42d46b5f357cd63f9891715b664f6fc

imported patch ext/stats_updates.patch

--HG--
extra : rebase_source : 4697ba9eb1ca8c67fe0915fb8340d7d4ae94caba

O3: Remove hardcoded tgts_per_mshr in O3CPU.py.

There are two lines in O3CPU.py that set the dcache and icache
tgts_per_mshr to 20, ignoring any pre-configured value of tgts_per_mshr.
This patch removes these hardcoded lines from O3CPU.py and sets the default
L1 cache mshr targets to 20.

--HG--
extra : rebase_source : 6f92d950e90496a3102967442814e97dc84db08b

Device: Make changes necessary to support a coherent page walker cache.

Adds the flag 'recvSnoops' which enables pagewalkers using DmaPorts,
to properly configure snoops.

--HG--
extra : rebase_source : 64207bef62c3268ddff2236ee4adae873812325f

ARM: Add support for having a TLB cache.

--HG--
extra : rebase_source : 7a5780ab74d7c294682738c7ccb3ce8d56c6fd63

ARM: Add IsSerializeAfter and IsNonSpeculative flag to the syscall instruction .

Squashes the subsequent instructions in O3 pipe after the service call, so that
they see the effect of the system call when re-executed. This isn't really an issue
with FS mode, but can show up in SE mode.

--HG--
extra : rebase_source : 613a69fe1d9834261e25a8cd340aa6b47578e1fe

O3: Add stat that counts how many cycles the O3 cpu was quiesced.

--HG--
extra : rebase_source : 043b9307eef3c5b87f8e6370765641e016ed1fa7

X86: Fix a bad segmentation check for the stack segment.

--HG--
extra : rebase_source : 755f4f6eae52f88ed516a1f1ac9e2565725d89c1

SPARC: update SE stats for FP fix

--HG--
extra : rebase_source : 954a009a9f8eef6cae6050ee99f264e0fb456f85

SPARC: Minor style fix.

I forgot to fix this as well per Ali's feedback.

--HG--
extra : rebase_source : e70d031cb5f91e2212a1a73ea1769bf0549b826c

SPARC: Fixing a minor copy-paste bug using the wrong variable

There was a bug in the mm_disk implementation where a copy paste error
resulted in the d32 variable not being initialised (as it incorrectly
was used instead of d16), and gcc 4.5 complaining.

--HG--
extra : rebase_source : 9515e87b188b9eac189da8034cb13c3bf7d9e20b

SPARC: Update the FS stats for the recent FP fix.

--HG--
extra : rebase_source : 643e3541507576e30d9cd4dec045e5b94532c342

SPARC: Isolate FP operations enough to prevent code/rounding mode reordering.

--HG--
extra : rebase_source : ee79ab89c5a707c1294f38abb84c60f8ef64196c

Compiler: Add an M5_NO_INLINE define.

--HG--
extra : rebase_source : 1f5e8b7bb6b0a8bb4f951b6d7189964d96ed5df1

Topology: bug fix in external link initialization

--HG--
extra : rebase_source : c226cd1e5e5ed4d4c64fa9427de4905bd8335e34

Remove standard_1level_CMP-protocol.sm include statement from Network

--HG--
extra : rebase_source : 51a2dd4bb643e3dc5b0218a6190cf5c1989f9691

X86: Fix the constant detecting three byte opcodes in the predecoder.

--HG--
extra : rebase_source : b64c3d2348cb73177024695fb6e205d51bf1cda9

Regression: Update statistics for x86 long regression tests
This patch updates reference statistics for the regression tests. This
update was necessitated by a recent change in behavior of some instructions
in the x86 architecture.

Ruby: Process packet instead of RubyRequest in Sequencer
This patch changes the implementation of Ruby's recvTiming() function so
that it pushes a packet in to the Sequencer instead of a RubyRequest. This
requires changes in the Sequencer's makeRequest() and issueRequest()
functions, as they also need to operate on a Packet instead of RubyRequest.

GCC: Guard some gcc flags so they're used when available and needed.

Tests: Update stats due to addition of fence microop

GARNET: adding a fault model for resilient on-chip network research.

This patch adds a fault model, which provides the probability of a number of
architectural faults in the interconnection network (e.g., data corruption,
misrouting). These probabilities can be used to realistically inject faults
in GARNET and faithfully evaluate the effectiveness of novel resilient NoC
architectures.

MESI Protocol: Add functions for profiling misses

x86: Add microop for fence
This patch adds a new microop for memory barrier. The microop itself does
nothing, but since it is marked as a memory barrier, the O3 CPU should flush
all the pending loads and stores before the fence to the memory system.

Protocol: Remove standard one and two level files

Ruby: Remove some unused typedefs
This patch removes some of the unused typedefs. It also moves
some of the typedefs from Global.hh to TypeDefines.hh. The patch
also eliminates the file NodeID.hh.

GCC: Get everything working with gcc 4.6.1.

And by "everything" I mean all the quick regressions.

Commit due to merge.

Python: Remove import for random

Ruby FS: Add the options for kernel and simulation script
These options were missing from the script ruby_fs.py. This patch adds these
options to the script.

Merged with recent changes.