Working fix for bugs 610 and 643 regarding check-model with preprocessed quantified formulas.

Fix bugs related to fmf with incremental. Reinitialize sorts on user pop, bug fix enumeration for uninitialized sorts, do not decide combined cardinality constraints that have not been allocated in user context. Fixes bug 654.

Fix bugs 605 and 667.

fix regressions

Merge remote-tracking branch 'origin/master'

Fixed but with getAssertions

Minor improvement to sygus sol reconstruction.

Improvements to sygus, register equivalent terms based on rewrites of original conjecture, set default invariant template mode to post-condition.

Do ITE term bookkeeping when solving Sygus inputs.  Add missing script from Sygus comp 2015. Fix bug 665 regarding strings rewriter for contains.

Modify slow regressions.

Minor improvements to cbqi, fix bug in solving with vts symbols, round up for integer lower bounds.  Add presolve infrastructure to quantifiers engine, modify --cbqi-prereg-inst.

Use zero in cbqi when not using infinities.

Added threshold for core bv cardinality lemmas

Fix for bv core cardinality lemma generation

eager bit-blasting gives models for boolean variables too (fixes bug618)

Improvements to vts in cbqi, bug fix vts for non-atomic terms containing vts symbols. Move presolve for sygus to cbqi. Enable --cbqi-recurse by default, add option --cbqi-min-bound. Enable qcf for finite model finding by default.

Minor changes related to codatatypes for 1.5 release.

Fix disequality bounds in cbqi, record literals for ITE skolems in cbqi.  Enable redundant ITE branch elimination in quantifiers rewriter.

better handling for conflicting options with nonlinear arith (bug 646)

Fix bug 649 (errors to regular output channel)

From SMTLIB standard:

  "Regular output, including error messages, is printed on the
   regular output channel..."

For CVC language, the behavior is unchanged (i.e. errors go
to stderr by default).

fix to bug659 due to algebraic solver model building

fix for bug660 and bug658 due to incorrect bit-blasting of divison by zero

Make cbqi robust to term ITE removal.  Separate vts infinities for int/real.

fix bug 605

Implementation of model-based projection in cbqi, cleanup, add regressions.

fix for bug663

More optimizations to --macros-quant, add --macros-quant-mode=ground-uf. Cleanup varContains caches in term db. Fix bug related to macros in non-tracing builds.

Improvements to --macros-quant. Enable --clause-split by default. Bug fix for cbqi regarding instantiations with free skolems, extend to boolean quantification. Infrastructure for congruence closure with free variables.

Simplification/improvement to solving deltas in LRA cbqi. Bug fix sygus datatypes.

Support for default grammar for datatypes in sygus. Support vts for infinity.

Make --fmf-fun and --macros-quant work in incremental mode. Add regressions.

Sygus support for inductive datatypes.

Implement virtual term substitution for non-nested quantifiers.  Fix soundness bug in strings related to explaining length terms.

Disable bug590.smt2

minor change to the last fix

Merge branch 'master' of https://github.com/CVC4/CVC4

Hotfix for substr function.

Add option --sygus-inv-templ for synthesizing strengthening/weakening of pre/post conditions.  Dump synth by default in sygus, update regressions.  Set better defaults for induction. Fix bug in related to IFF and EQUAL in sygus grammar.

Fix for BOOST_SED_CPP for gcc-5.

Squashed merge of SygusComp 2015 branch.

Add option --full-saturate-quant-rd.  Fix option --register-quant-body-terms.

fix bug 650

Add options --partial-triggers, --elim-taut-quant, improve robustness of --purify-triggers. Enable --quant-alpha-equiv by default. Fix fairness issue when combining cbqi+E-matching.  Avoid unecessary delta lemmas.  Update casc scripts.

On-demand upper bound lemmas for deltas in quantified LRA (for casc). Force no macros-quant in incremental. Update casc TFN script.

Add options --qcf-all-conflict, --ite-dtt-split-quant, refactor --ite-lift-quant. Minor bug fixes for internalReps, alpha equivalence.  Update casc 25 FOF script.

fix sets-translate

fix smt2 parameterized sort printing

Module to infer alpha equivalence of quantified formulas.  Minor clean up of options.

Refactor various corner cases of fmf, quantifiers modules. Enable cbqi2 by default on pure quantified arithmetic. Fix bug in sort inference related to mixed real/int, add regression.

Do not assert fail for fmf empty domains. Fixes bug 644.

Add --user-pat=interleave. Remove unused lte inst strategy.

Avoid completion for large finite types.  Fix bug for --fmf-fun.

Make array basis term a skolem (avoids crashing in fmf).

Changing options for QF_AUFNIA to avoid bug

Fixing an assertion Constraint::assertionFringe(...) to allow hasTrichotomyProof().

Handing the case in replay where a cut is directly in conflict with an existing bound.

Fixes for shared term normalization in replay for constraint construction.

Turning off aggressive arith ite simplifications during incremental solving.

Robust check to avoid store all instantiations. Fix prior commit for sort inference.

Changing the run script for master for the application track.

Restricting TheoryArith to computeRelevantTerms.

Disable sort inference for SMT COMP

Fixed bug in iteSimp

Fix for assertion failure:
smt_engine.cpp:1992: Rewriter::rewrite(d_assertions[i]) == d_assertions[i]
when --ite-simp and --repeat-simp are on

Fix for sort inference involving mixed Int/Real equalities.

A return value for an ApproxGLPK::loadVB() failure case was incorrect.

Avoid instantiating with array constants.

Ensure mkRep instantiation strategies do not violate types.

sync options of default-assertions run script with default

Fix crash in non-linear cbqi.

In TheoryArithPrivate::vectorToIntHoleConflict, adding check for whether or not negBack is already in conflict. This is needed as it can be called multiple times on the same constraint.

Make sygus an output language.  Parse declare-fun in sygus.  Minor improvements to robustness of sygus parsing.

Accelerate sygus solution reconstruction for constants and id functions.  Minor changes to sygus type registration.  Print sygus let solutions assuming fixed variable names.

remove runscripts from master meant for experimental submission

Avoid naming conflicts in sygus, refactor. Add missing regression.  Detect Start grammar. Add regression.

Handle duplicate operators in sygus grammars.  Parse sygus quoted literals. Add regression.

Update experimental scripts.  Support top-level non-terminals in sygus grammars.  Allow -N in sygus terms.  Minor bug fix in datatypes_sygus. Add regression.

Bug fix parsing constant constructor sygus.

Support for printing solutions involving LetGTerm sygus. Bug fix define-fun within LetGTerm sygus.  Bug fix sygus argument generalization.  Add regressions.

Parse support for sygus LetGTerm.

bump thread stack size to 1 GB

Bug fix instantiations for fmf-bound-int.  Disable nested pre-skolemization for non-UF logics.  Update SMT COMP scripts accordingly.

make comment precise

move delete beyond ifdef CVC4_COMPETITION_MODE

pcvc4 with assertions

update run script for assertions/scrambled run

assertions runscript (for testing) derived from current stable (default) script

for experimental, use incremental instead of teardown for all logics for testing purposes

move decision to use teardown or not to logics

Fix for last commit.

rpl -- "--cbqi" "--cbqi --no-cbqi-sat" run-script-smtcomp2015{,-application}

sync exerimental scripts with regular ones

Minor changes to smt comp script for quantified arith.  Add option --cbqi-sat whether to disable sat for quantified arith.

experimental run scripts

runscript thread stack 256

Refactoring of sygus parsing, properly parse Constant/Variable constructors.

application smtcomp

Flatten sygus grammars during parsing. Remove duplicate operators from grammars.

Add casc 25 tfn script.  Change tff script to output instantiations. Work towards parsing non-flattened sygus grammars.

When proof enabled, disable uf sym break. Add regression.