(proof-new) Add bound variable manager (#5655)

This is a common utility for constructing canonical bound variables.

Fix and improve evaluator (#5563)

This fixes a segfault in the evaluator for substitutions of the form x -> t where t is not constant.

This consolidates 2 cases where we did not evaluate children (when we are variable or are an application term with an unevaluated child). This was problematic previously since we would access children of currNode instead of currNodeVal.

This also makes our handling of APPLY_UF more consistent, so that it is added to the main switch statement.

Fix SAT-context dependent issue in strings preregistration (#5564)

This makes preregistration of terms SAT-context dependent in strings instead of user-context dependent.

Fixes #5547.

This is required to avoid model unsoundness on sequence benchmarks, as demonstrated in that issue.

It furthermore impacts how we have been handling theory combination with arithmetic for str.len and impacts how propagation is setup for the strings equality engine.

I will do performance testing on this PR.

Flush statistics through NodeManager in SmtEngine (#5652)

This removes the dependency on the Expr layer from src/main.

This requires moving the flushing of NodeManager statistics within SmtEngine.

This is a temporary solution until we have a permanent solution for statistics.

bv-to-int: new tests from an issue (#5654)

#5293 pointed to assertion failures when employing --bv-to-int, starting from commit 94e3d9a.
The bug is not reproduced on current master, and so we would have this PR close #5293 .
This PR adds the benchmarks from #5293 .

 [proof-new] Updating theory proxy to new proof infrastructure (#5653)

Fix length assumption for deq norm emp rule (#5623)

There is an assumption that is not guaranteed to hold in this rule, thus we should not try to explain in the equality engine.

Fixes #5611.

Note this inference was not previously covered in our coverage build.

Refactor KindMap (#5646)

The KindMap class is only used in the EqualityEngine and implements way more than necessary.
This PR removes all the functionality that is never used.

google test: expr: Migrate node_algorithm_black. (#5643)

Refactor regressions (#5639)

This adds a net +82 regressions to regress[0-2] and adds several additional disabled regressions to regress3 and regress4. This involved fixing the status on several regressions, and ensuring CMakeLists.txt includes all files (exactly once) in the test/regress/ subdirectory.

It also moves several regressions to the proper regression levels (those that take >30 seconds in debug are moved to regress3+).

google test: expr: Migrate kind_black. (#5634)

Fixed a bunch of clang warnings. (#5637)

Fix compiler warnings. (#5644)

(proof-new) Make theory preprocessor proofs self contained (#5642)

Previously, there was a block of code in TheoryEngine::lemma for processing the proofs from theory preprocessing.

It is much cleaner if this block was self contained in TheoryPreprocessor.

This is required for the planned move of TheoryPreprocessor from TheoryEngine -> PropEngine.

google test: expr: Migrate kind_map_black. (#5640)

kind_map: Remove unused Accessor class. (#5641)

google test: expr: Migrate attribute_white. (#5632)

Make decision engine independent of AssertionsPipeline (#5626)

This PR makes decision engine independent of AssertionsPipeline, which consequently allows some of the key PropEngine interfaces to be consolidated. It also modifies PropEngine to take TrustNode for assertLemma, which is the first step for making PropEngine manage proofs from TheoryEngine.

This is in preparation for modifying the interplay between PropEngine, TheoryEngine, TheoryPreprocessor, and new proposed SAT relevancy heuristic.

There are no intended behavior changes in this PR.

Marking "major" since this impacts several current directions (including proof-new integration, lazy theory preprocessing, SAT relevancy).

Remove obsolete regressions (#5633)

This removes benchmarks for the following reasons:

- regress1/arith/arith-int are removed since there are many similar regressions (10 from this set are already enabled)
- bitvector cvc benchmarks are removed since their *.smt2 benchmarks are enabled
- other benchmarks are removed due to features we do not plan to support
- one placeholder benchmark is removed

google test: context: Migrate context_white. (#5630)

google test: context: Migrate context_white.

Split initial exp lemma into separate lemmas. (#5622)

This PR refactors the initial lemmas for the exponential function, very similar to the sine lemmas.

Delete obsolete unit tests for Expr and ExprManager. (#5631)

This is already in preparation for removing the Expr layer.

Ensure CEGQI is applied for parametric datatypes when applicable (#5628)

Previously was a bug computing the argument types of parametric datatypes.

Do not check FP at last call if not necessary (#5627)

This makes the theory of floating points not request a last call effort check, if that call is known to do nothing.

This should make CVC4 (more) agnostic to whether --symfpu is enabled during configuration.

ite_utilities: Fix infinite loop in compressTerm. (#5629)

Fixes #4610.

update doc (#5619)

The current help message for --bv-div-zero-const only mentions bvudiv (in which the result is -1) and not bvurem (in which the result is the first argument).
I think this is a bit misleading, because in practice, this option controls also the behavior of bvurem:
CVC4/src/theory/bv/theory_bv.cpp

Line 134 in 0309ef4

 if (options::bitvectorDivByZeroConst())
This PR is an attempt to provide a more accurate help message.

google test: context: Migrate context_mm_black. (#5592)

google test: context: Migrate context_black. (#5587)

Add regression from #1978. (#5552)

This PR adds a regression from #1978 that has been fixed in the meantime.
Closes #1978 .

Fix a bug with synth-fun printer (#5512)

This PR fixes #5448. SynthFunCommand::toStream used to call d_grammar->resolve even when d_grammar is a nullptr. This PR fixes the issue and modifies the signature of Printer::toStreamCmdSynthFun to make it clear that grammar is an optional argument.

[proof-new] Updating SAT proof to use MACRO_RESOLUTION (#5613)

bv-to-int: Expand definitions of bvudiv and bvurem during bv-to-int preprocessing pass (#5620)

#5544 enforces expandDefinition not to run before preprocessing.
The bv-to-int preprocessing pass used to rely on expandDefinition to replace BITVECTOR_UDIV and BITVECTOR_UREM with their _TOTAL versions.
This PR performs the replacement in the preprocessing pass itself.
A regression that timed out is now fixed and is brought back to the regressions.

Make term indices in the strings base solver aware of types (#5589)

This is required for handling inputs that combine strings and sequences.

Fixes #5542.

Proper implementation of expand definitions for sequences (#5616)

Expand definitions for sequences was wrong in two ways: (1) we replaced str.from_code with a witness term. This led to it being unevaluatable in models. (2) we did not handle seq.nth, meaning its model value was unevaluatable if it was out of bounds. Now it evaluates the value of the uninterpreted function we replace with.

This corrects both issues and adds a regression to demonstrate both kinds of terms evaluate correctly.

To do this, I added a helper function to skolem cache as well as a new (internal-only) kind SEQ_NTH_TOTAL. Notice applications of this kind should only be used for model evaluation.

Notice this fixes several check-model warnings in the regressions. It still does not fix others since other things must be corrected for model evaluation (e.g. expandDefinitions must be applied on theory assertions for --debug-check-models). This will be done in later PRs.

Fix collect model values for sequences of sequences (#5579)

Fixes #5543.

Recently we changed our model construction for sequences here: #5391.

This fix is not safe for sequences of sequences, where Valuation::getModelValue should not be called, since the argument of the seq.unit is not a shared term.

This makes our model construction for sequences more robust, however I'm not sure this is the end solution. In particular, it is still questionable whether we should call Valuation::getModelValue at all (consider sequences of theories whose model construction comes after strings), or for cases of (seq.unit x) where x is a sequence or string that does not have a concrete value. Regardless, this PR could be merged in the meantime since it should definitely fix some of the current issues.

[proof-new] Adding MACRO_RESOLUTION rule and updating proof checker (#5612)

Previously CHAIN_RESOLUTION's definition and checker were not properly capturing its intended behavior as merely an n-ary RESOLUTION rule (i.e., no factoring nor reordering). A new rule, MACRO_RESOLUTION, now captures this behavior: it combines CHAIN_RESOLUTION, FACTORING, and REORDERING.

This commit also adds a proof checker for the new rule and updates the proof checker of CHAIN_RESOLUTION.

Add support for BV proofs with the simple bitblasting solver. (#5603)

Disable algebraic BV subtheory by default and make experimental. (#5596)

Fixes #5370, #5462.

Fix and reenable fact vs lemma optimization in datatypes (#5614)

This corrects an issue where terms internal to datatypes were not getting properly registered e.g. as part of the indices that determine the care graph, due to a context-independent cache being used (when a SAT-context-dependent one was required).

This reenables the fact vs lemma optimization in datatypes, as it is conjectured to be correct.

Add bitwise refinement mode for IAND (#5328)

Adds an option to do "bitwise" comparisons in the lazy IAND solver. Instead of creating an exact match for the value of a term using a sum, this would lazily fix groups of bits using integer extracts (divs and mods) when the abstract and concrete values differ at those bits.

For example, with a 1-bit granularity, you might learn a lemma like:

((_ iand 4) x y), value = 1
  actual (2, 3) = 2
  bv-value = #b0001
  bv-actual (#b0010, #b0011) = #b0010
IAndSolver::Lemma: (let ((_let_1 ((_ iand 4) x y)))
         (and (and true
                  (= (mod _let_1 2) (ite (and (= (mod x 2) 1) (= (mod y 2) 1)) 1 0)))
                  (= (mod (div _let_1 2) 2) (ite (and (= (mod (div x 2) 2) 1) (= (mod (div y 2) 2) 1)) 1 0))))
        ; BITWISE_REFINE

which is just forcing the bottom two bits of the iand operator result to implement bitwise-AND semantics.

Fix issue with free variables introduced by quantifier rewriter (#5602)

This was caused by the quantifiers rewriting eliminating extended arithmetic operators, which was required due to the way counterexample-guided quantifier instantiation used to work with preprocessing. The technique is now more robust and this option can be deleted.

This fixes a debug assertion failure from UFNIA SMT-LIB, a minimized benchmark is included as a regression.

Refactor initial phase of transcendental solver (#5599)

This PR refactors the initialization of the transcendental solver, decoupling the setup of generic caches from initial lemmas for exponential and sine functions.

Do not expand theory definitions at the beginning of preprocessing (#5544)

This updates the preprocessor so that expand definitions does not expand theory symbols at the beginning of preprocessing.

This also restores the previous expandDefinitions method in arithmetic, which is required for correctly interpreting division by zero in models, but should not be applied at the beginning of preprocessing. Moreover it ensures that only partial operators are eliminated in arithmetic expandDefinitions, which required an additional argument partialOnly to arith::OperatorElim.

This adds -q to suppress warnings for many quantified regressions which now emit warnings with --check-model. This will be addressed later as part of CVC4/cvc4-wishues#43.

The purpose of this PR is two-fold:
(1) Currently our responses to get-value are incorrect for partial operators like div, mod, seq.nth since partial operators can be left unevaluated.
(2) The preprocessor should have the opportunity to rewrite and eliminate extended operators before they are expanded. This is required for addressing performance issues for non-linear arithmetic. It is also required for ensuring that trigger selection can be done properly for datatype selectors (to be addressed on a later PR).

 (proof-new) Split proof ensure closed checks to own file (#5522)

Split proof ensure closed checks to own file

Add regression from #4927 (#5556)

The error from #4927 has been fixed in the meantime, this PR adds the example as regression.
Closes #4927.

Fix bugs in getFreeVariables (#5601)

Did not consider scopes properly, which would fail to say that formulas with escaped variables (both bound and unbound) in formula had free variables.

Change generated options to be thread_local. (#5583)

Signed-off-by: Everett Maus <evmaus@google.com>

google test: expr: Migrate attribute_black. (#5598)

google test: context: Migrate cdo_black. (#5586)

google test: context: Migrate cdmap_white. (#5585)

Fix bug in hasBoundVar (#5600)

Led to issues while debugging another issue related to free variables in assumptions.

google test: api: Migrate sort_black. (#5594)

google test: context: Migrate cdmap_black. (#5584)

google test: context: Migrate cdlist_black. (#5582)

Use NodeDfsIterable for makeBinary (#5595)

Replaces the manual dag traversal in BVToInt::makeBinarywith NodeDfsIterable.

This is a subset of the changes in #4176, updated to apply to master.

update-copyright: Preserve file permissions. (#5597)

When updating the copyright headers file permissions were not preserved. In some cases this results in losing the permission to execute scripts. This commit makes sure to preserve the file permissions for updated files.

(proof-new) Updates to SMT proof manager and SmtEngine (#5446)

This PR adds infrastructure in SmtEngine and ProofManager for checking and printing proofs. It updates a previous interface that used ProofGenerator in favor of ProofNode.

This makes it so that it only remains to make PropEngine to be proof producing.

google test: api: Migrate solver_black. (#5570)

Use mkAnd where the number of children may be less than two. (#5551)

An AND was constructed from a vector that may only hold a single or no element.
This PR uses mkAnd instead.
Fixes #5550 .

Models as (#5581)

This PR relates to #4987 .
Our plan is to:

delete the model keyword (done in #5415 )
avoid printing extra declarations by default (done in #5432 )
wrap UF values with as expressions.
This PR does step 3, fixes a regression accordingly, and adds the formula from #4987 and a variant of it to the regressions.

google test: Add fixture for context tests. (#5590)

Context test PRs will be updated to use this after this is merged to
master.

Refactor handling of global declarations (#5577)

This refactors how global declarations are handled in the parser. In particular, we do not push/pop user contexts in the symbol table and manager when global declarations are true, which is an equivalent behavior to declaring symbols globally.

This further refactors to not use ExprManager flags, thus breaking most of the dependencies on the old API.

This is work towards fixing global declarations in the smt2 parser. The parser still does not behave correctly for overloaded symbols + global declarations (e.g. see #4767), which require further refactoring.

This is also work towards migrating the parser not to depend on the old API. There are a few miscellaneous things to change after this PR, but we are very close to breaking this dependency now.

Make run_regression.py executable. (#5588)

Update copyright headers.

google test: base: Migrate map_util_black. (#5580)

Fix RoundingMode mapping in API. (#5578)

Fixes #5524.

Remove Record object and convert to Node-level API (#5575)

Required for detangling NodeManager from the Expr layer.

Rename macro Message to CVC4Message. (#5576)

Remove dagification visitor (#5574)

This has fully been replaced by the new let binding.

google test: api: Migrate term_black. (#5571)

google test: api: Use individual fixture for datatype_black. (#5568)

This is to prevent name clashes with other tests.

Add associative utilities to node manager (#5530)

Required for updating the new API to use Node utilites as backend.

These utilities are copied directly from ExprManager and converted Expr -> Node.

google test: api: Migrate op_black. (#5567)

google test: api: Migrate grammar_black. (#5566)

Use new let binding for cvc printer (#5561)

Also changes names slightly to avoid accidental uses of toStream, which can lead to infinite loops if the wrong version is used.

(proof-new) Proofs for expand definitions (#5562)

Add regressions from #3687. (#5553)

The error from #3687 has been fixed in the meantime.
This PR adds the two examples from this issue as regressions.
Closes #3687

google test: api: Migrate result_black. (#5569)

google test: api: Migrate result_black.

Remove use of this-> in FP literal. (#5565)

Remove assertion related to CEGQI dependency lemmas (#5559)

This assertion does not hold when we mix --sygus-inst with normal CEGQI.

Should fix the nightlies.

google test: Infrastructure and first api test. (#5548)

This sets up the infrastructure for migrating unit tests from CxxTest to
Google Test. It further migrates api/datatype_api_black to the new
infrastructure.

Fix issues related to model declarations (#5560)

This corrects two issues related to model declarations:
(1) model declaration terms were mistaken not cleared,
(2) the model needs to be explicitly destructed before the node manager because it contains references to Node.

Fixes #5540

Improve rewriting of str.<= (#4848)

This commit improves our rewriting of str.<= slightly. If we have
constant prefixes that are different, we can always rewrite the term to
a constant. Previously, we were only doing so when the result was
false.

Refactor transcendental solver (#5539)

This PR does another round of refactoring on the transcendental solver. It cleans up some variable names, introduces an enum type for Convexity and passes both the intended taylor degree and the actual taylor degree (which will be needed for proofs).

Add regressions from #5099 (#5557)

The issue from #5099 has been fixed in the meantime, this PR adds the examples as regressions.
Closes #5099.

Add regression for #4335. (#5554)

The error from #4335 has been fixed in the meantime, this PR adds a regression for this issue.
Closes #4335.

Add regressions for #4707. (#5555)

The error from #4707 has been fixed in the meantime, this PR adds the example inputs as regressions.
Closes #4707.

More fixes for quantifier elimination (#5533)

Fixes #5506, fixes #5507.

fix metadata for a test (#5546)

A COMMAND was used instead of COMMAND-LINE.

fp_converter: Properly separate out symbolic glue code. (#5501)

File fp_converter.h encapsulates the symbolic glue code for symFPU and
implements the actual word-blaster (class FpConverter).
This header should not be included in any other headers in order to no
pull in symFPU headers where it's not needed. However, it was included
in src/theory/fp/theory_fp.h.

This properly separates it out and does some clean up in TheoryFP, which
still needs more love to conform to code style guidelines, and also
more documentation. More love and documentation is postponed to future
PRs to make reviewing easier.

Use new let binding in AST printer (#5529)

Required for removing the old DagificationVisitor

floatingpoint: Use unique_ptr for FloatingPointLiteral pointer. (#5503)

Eliminate uses of SExpr from the parser. (#5496)

This is a step towards migrating Commands to the API. SExpr is an internal module that's not used by the API but is used by the parser and some commands. This PR replaces SExpr with terms of kind SEXPR in the parser and strings in commands (which brings them more inline with the API).

Remove includes for old API from internal code (#5536)

The only code including the old API now are in parser/ and main/ which will require further untangling.

(proof-new) Proofs for regular expression elimination (#5361)

Adds support for proofs for regular expression elimination in TheoryStrings::ppRewrite via a coarse-grained rule RE_ELIM.
This rule is updated by this PR to distinguish whether we apply aggressive elimination. Aggressive elimination is not currently supported, since it is non-deterministic due to generating fresh BOUND_VARIABLE.

Make CAD solver work for empty set of assertions (#5535)

When called with no assertions, the CAD solver would still go to work and then segfault when trying to access the first variable.
This PR adds an explicit check for this case and adds a regression.
Fixes #5534 .

Removing infrastructure related to SMT model (#5527)

Now, SMT models do not store an internal list of commands, and are not dependent on a reference to SmtEngine.

The next cleanup step will be to merge OutputManager, DumpManager, and SmtEngineNodeListener.

Move expand definitions to its own file (#5528)

We are changing our policy on how expand definitions is handled during preprocessing.

This will require some additions to expand definitions handling. This PR makes a standalone module for expanding definitions.

Fully decouple SmtEngine and the Expr layer (#5532)

This removes the remaining dependencies of SmtEngine on the Expr layer. It now takes a NodeManager instead of a ExprManager.

Fix missed case of theory preprocessing (#5531)

This fixes a rare case of theory preprocessing where rewriting a quantified formula would introduce a term that would not be preprocessed. This led to solution unsoundness on a branch where the relationship between expand definitions and preprocessing is modified.

This is required for updating to the new policy for expand definitions.