Merge rebased_on_upstream into master

Some commits were upstreamed and the rest was rebased on upstream master.
Then the was merged in out master to keep continuos stream of commits.

whitespace (pep8)

add code-comments regarding potential use of FFSynchroniser

single-cycle mode fix on wb "wen" signal, must hold fully until ACKed

underscore names on submodules possibly interfering with verilator

if no wb stall assume single-cycle mode

resolve issue in coriolis2 with passing nmigen expressions rather
than signals to a submodule

add cocotb as a test dependency (not an install dependency)

removing cocotb from install dependencies, it is a test dependency
not an operational dependency;

code-cleanup / comments on JTAG IO

add DMI interface to JTAG TAP

fix wishbone optional stall

add default features over-ride option to wishbone

whitespace cleanup

whitespace cleanup

nmigen explicit imports

Remove generated test file.

Fix path for env

comment on why clocks are in FSM

modgrammar dependency

Typo (is -> ==)

svfcocotb: Fix results access for SDR and SIR.

svfgrammar: Forgotten SVF statements.

Support lower case hex letters.

Connect tdi to tdo for boundary scan without IOs.

Remove generated test file.

Fix path for env

Connect tdi to tdo for boundary scan without IOs.

Handle case with zero IO cells for boundary scan.

Comment sections in TAP.elaborate()

Merge upstream master in libre-soc master.

whitespace (pep8)

comment on why clocks are in FSM

add code-comments regarding potential use of FFSynchroniser

single-cycle mode fix on wb "wen" signal, must hold fully until ACKed

underscore names on submodules possibly interfering with verilator

if no wb stall assume single-cycle mode

nmigen-soc dependency

modgrammar dependency

Typo (is -> ==)

svfcocotb: Fix results access for SDR and SIR.

svfgrammar: Forgotten SVF statements.

Support lower case hex letters.

Revert "remove scm_version from setup.py"

This reverts commit 8241c4fdf5d89c710b073c3a6544f7cc7c944e02.

remove scm_version from setup.py

resolve issue in coriolis2 with passing nmigen expressions rather
than signals to a submodule

correctly test length of IOs

do not need to do IOconn

add cocotb as a test dependency (not an install dependency)

removing cocotb from install dependencies, it is a test dependency
not an operational dependency;

code-cleanup / comments on JTAG IO

add DMI interface to JTAG TAP

fix wishbone optional stall

add default features over-ride option to wishbone

whitespace, comments

whitespace cleanup

whitespace cleanup

nmigen explicit imports

Fix cocotb path for c4m_jtag_svfgrammar.

BinaryValue API change.

Update the unit tests.

* Add test for custom shiftreg
* Add Wishbone JTAG port test.

cocotb improvements

* Made ir_width configurable.
* Allow to use BinaryValue for load_ir.

Made nmigen code independent of VHDL code.

All blocks have been converted to nmigen.

Support for different IO types in VHDL code.

IO cells can now be input, output, tri-state output, tri-state
inout. Update tests and added separate test for c4m_jtag_ioblock.

Force passing by name for TAP.add_shiftreg().

Also clean python cache.

Added test bench for nmigen TAP with cocotb.

Based on vhdl controller test bench.

Fix order of iocells in ioblock.

Specify names for TAP signals.

Basic nmigen generator bench for TAP top cell.

Simple generation with nmigen and yosys as only dependency.

Fix paths after move.

[broken]Moved test benches to test/vhdl

test/vhdl will be for test benches of the vhdl code; test/nmigen for the
nmigen code.
This just moves the files. They will be fixed in next commit.

Move idcode.vhdl to test/ghdl/idcode

Remove unused bench

Made STATE and NEXT_STATE internal to c4m_jtag_tap_fsm.

This also makes the STATE_TYPE type internal to c4m_jtag_tap_fsm.

Pass VERSION generic from controller to idblock.

Moved function definitions before component definitions in pkg.

Added TODO for IOMODEs.

Add top controller instance from nmigen code.

Currently ghdlsynth needs instantiated cell with given generic values.

Simplify signal generation for TAP wishbone interfaces.

Use Elif for third m.next assignment.

This way m.next assignments are done in one If/Elif statements for
the "IDLE" state and not in two different If statements.

Use Wishbone code from nmigen-soc.

Support JTAG bus with a reset signal.

Rework ShiftReg and Wishbone elaboration.

- ShiftReg is now a Record subclass just providing the interface for
  user code.
- JTAGWishbone class is removed.
- elaboration for ShiftReg and Wishbone is now done in
 _elaborate_shiftregs() and _elaborate_whishbones() TAP methods.

Use the JTAG Interface class as bus.

Get Wishbone from c4m lib.

Rename JTAG to TAP.

Renamed jtag.py -> tap.py.

Added JTAG bus interface.

Move pmod resource to own file and convert it in one function.

python setuptools files

Fix code after move

* tests fixed
* path to vhdl source

[broken]Move code

Moved files without any changes to easily track later changes.

Setup new structure for code

New structure will be compatible with easy pip/conda installing.

Made _add_files static method of JTAG.

Update test code for interface change of c4m_jtag_tap_controller.

Handle stall signal.

Added nmigen wrapper and support code for JTAG interface.

nmigen code has support for adding shift registers and a Wishbone bus
master that is drive by JTAG commands.

Only add assert statement if DEBUG generic is true.

Default value is false.

cocotb/c4m_jtag: support trst_n to be None.